DPP-4与氰基吡咯烷类抑制剂相互作用的分子动力学模拟

• 作者: 朱小蕾 王伟 董珂珂 顾勇亮
• 来源期刊: 南京工业大学学报（自然科学版）
• 学科: 化学
• 关键词: 分子动力学模拟 MM-PBSA方法 二肽基肽酶-4 氰基吡咯烷抑制剂
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 120-124
• 页数: 5页
• 分类号: O643.1
• 字数: 2775字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7627.2015.03.022

摘要

通过分子对接、分子动力学(MD)模拟和自由能分析的方法研究3种氰基吡咯烷抑制剂与二肽基肽酶-4(DPP-4)之间的成键机制,分析和讨论3种抑制剂与二肽基肽酶之间的静电相互作用、范德华相互作用.用MM-PBSA方法计算得到的3种抑制剂的结合自由能与实验测得的结果是一致的.抑制剂与残基所形成的氢键能够使抑制剂稳定在结合位点.由残基Tyr631和Tyr666与抑制剂形成的范德华相互作用对结合自由能起到关键作用,并且显著地将3种不同抑制剂的生物活性区分开来.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伟	南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室	54	548	14.0	21.0
2	朱小蕾	南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室	44	52	4.0	6.0
3	顾勇亮	南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室	2	0	0.0	0.0
4	董珂珂	南京工业大学化学化工学院材料化学工程国家重点实验室	7	1	1.0	1.0