茶树CsCDF1基因克隆及表达分析

• 作者: 吴立赟 张成才 张芬 成浩 王丽鸳 胡娟 韦康
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 Dof基因 CsCDF1基因 光调控 氮素 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 页码范围: 501-511
• 页数: 11页
• 分类号: S571.1|Q52
• 字数: 4823字
• 语种: 中文

摘要

采用SMART-RACE技术克隆了茶树Dof（DNA binding with one finger）基因CsCDF1的全长cDNA序列，并利用在线生物信息学软件对其进行了分析。采用实时荧光定量 PCR 分析该 Dof 基因在茶树不同组织间的表达差异和昼夜表达规律，及其在氮饥饿处理2周后对不同浓度氮素诱导的响应。该cDNA序列全长1606 bp，包含1个编码464个氨基酸的完整开放阅读框，含有高度保守的DOF结构域，推导的蛋白分子量为50.8 kDa，理论等电点（PI）为5.52；其编码的蛋白序列与茸毛烟草、马铃薯和美花烟草的CDF蛋白（Cycling dof factor）相似性分别为69%、67%、68%。系统发育分析结果表明，该基因编码的氨基酸序列与拟南芥CDF蛋白聚为一类，因此将其命名为 CsCDF1；CsCDF1在3个不同茶树品种根系中的表达量均高于一芽二叶和成熟叶；在一天中，该基因的表达呈现出昼夜节律变化；在氮饥饿后重新供氮，不同组织中该基因对不同浓度氮素的响应均为上调。