极端粒形水稻品种GS5基因的序列及效应分析

• 作者: 丁丹 张亚东 梁彦丽 王才林 郑佳
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 GS5 克隆 简单重复序列(SSR)
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种?生理生化
• 页码范围: 951-956
• 页数: 6页
• 分类号: S511|Q785
• 字数: 3031字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.05.001

摘要

为明确粒型控制基因GS5在2种极端粒型水稻中的序列差异和作用,本研究利用极端大粒型水稻品种TD70和小粒型水稻品种Kasalath对粒宽控制基因GS5进行了克隆和序列分析,根据序列比对结果设计分子标记,用来区分不同来源的GS5基因,并结合重组自交系的粒型信息分析该基因对粒型的调节作用。结果显示,该基因包含10个外显子和9个内含子,与TD70的GS5基因相比,Kasalath的GS5基因第1外显子上编码的第31位氨基酸由甘氨酸变成丙氨酸,同时在第36、37位缺失2个甘氨酸。以这2个氨基酸的缺失为基础,设计简单重复序列( SSR)分子标记并在2个品种及其重组自交系( RIL)中进行了验证。利用该标记可以在含有GS5-T的品种中扩增出216 bp的片段,在含有GS5-K的品种中扩增出210 bp的片段。对重组自交系的检测结果显示,含有GS5-T基因的株系有122个,含有 GS5-K基因的株系有118个。含 GS5-T基因的株系平均粒宽比含GS5-K基因的株系平均粒宽高出0.47 mm,千粒质量高出2.87 g,说明 GS5是水稻粒宽性状的主效调控基因。