异育银鲫GABA A受体γ2亚基全长克隆及生物信息学分析

• 作者: 周爱玲 孙琪 杨先乐 胡鲲 赵依妮 阮记明
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 异育银鲫 GABA A受体γ2亚基 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 191-198
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.04.028

摘要

近年来GABA A受体亚基特异性在药物筛选、研发过程中的应用得到广泛地关注，其中有关α1、β2和γ2三种功能性亚基的研究最为深入。异育银鲫因其良好的生长、繁殖优势，在国内得到广泛养殖。采用RACE法克隆得到了异育银鲫GABA A受体γ2亚基基因全长cDNA，并进行了生物信息学分析。该基因长2763 bp，其中CDS区长1437 bp，可编码477个氨基酸的前体蛋白。预测蛋白分子量55.3 kD，理论等电点9.13。异育银鲫体内GABA A受体γ2亚基氨基酸序列N端存在1个长度为35个氨基酸的信号肽，4个长度分别为23、20、23和23个氨基酸的跨膜区，3个N-糖基结合位点和2个O-糖基化位点，1个特异性结构域，其氨基酸序列具有明显的氯离子门控通道家族特征。氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性都在89%以上，表明该蛋白属于GABA A受体亚基家族。系统进化树表明异育银鲫与斑马鱼聚为一支，亲缘关系最近。