羊草钙依赖型蛋白激酶基因生物信息学及表达特性分析

• 作者: 刘忠野 崔喜艳 张继伟 秦思余 郭继勋
• 来源期刊: 中国草地学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 羊草 CDPK基因 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 11-18
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 6231字
• 语种: 中文

摘要

为了研究钙依赖型蛋白激酶(CDPK)在羊草适应生境中的功能,分别对羊草幼苗进行模拟干旱(PEG)和盐碱(NaCl-Na2 CO3)处理,测序分析了羊草中克隆的CDPK基因cDNA(LcCDPK),其核酸序列全长为1704 bp,开放阅读框为1647 bp,共编码548个氨基酸,编码的氨基酸序列与GenBank中小麦CDPK1基因的同源性最高,氨基酸一致性为96％.用软件对其蛋白质氨基酸组成及结构分析,氨基酸序列构成具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化活性的S-TKc结构域,有4个保守的EF手性结构域,为Ca2+结合位点,预测的成熟肽相对分子质量61.349KDa,理论等电点5.34;二级结构预测α-螺旋占37.59％,β-折叠占9.85％,而无规则卷曲占52.55％;实时荧光定量PCR结果分析表明,在低浓度PEG、盐碱处理条件下羊草根及叶片的CDPK基因表达下调,高浓度处理条件下CDPK基因表达上调,说明CDPK基因表达受干旱及盐碱胁迫调控;盐碱处理条件下CDPK基因在根和叶片中的表达均高于干旱处理.推测LcCDPK广泛参与羊草抵御逆境胁迫的响应,尤其在盐碱胁迫过程中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔喜艳	吉林农业大学生命科学学院	62	454	14.0	18.0
2	刘忠野	吉林农业大学生命科学学院	8	37	4.0	6.0
3	秦思余	吉林农业大学生命科学学院	2	8	2.0	2.0
4	张继伟		3	53	3.0	3.0