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摘要:
16S rRNA测序是高通量测序依赖的肠道微生物研究方法之一,该方法可以对肠道微生物中的所有菌种进行精确定量,因此正逐渐成为研究肠道微生物菌种丰度变化的主流。肠道微生物16S rRNA测序的应用过程中有两个问题至关重要,一是如何根据需要选择测序方案;二是面对高通量测序得到的海量数据,如何进行生物信息学分析,以得到具有生物学意义的结果。从测序平台、测序片段、测序数据量的选择3个方面讨论了如何选择测序方案,并从序列聚类与注释、群落结构分析、关键分类单位的筛选与功能分析等方面对目前常用的生物信息学分析手段进行综述。
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文献信息
篇名 16S rRNA测序技术在肠道微生物中的应用研究进展
来源期刊 生物技术通报 学科
关键词 肠道微生物 16S rRNA 高通量测序
年,卷(期) 2015,(2) 所属期刊栏目 技术与方法
研究方向 页码范围 71-77
页数 7页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.02.010
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 许文涛 中国农业大学食品科学与营养工程学院 109 782 15.0 23.0
5 李东萍 中国农业大学食品科学与营养工程学院 3 77 2.0 3.0
6 郭明璋 中国农业大学食品科学与营养工程学院 6 77 3.0 6.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
肠道微生物
16S rRNA
高通量测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物技术通报
月刊
1002-5464
11-2396/Q
大16开
北京海淀区中关村南大街12号
18-92
1985
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
相关基金
北京市科技新星计划
英文译名:
官方网址:http://www.lawol.org/difang/0611112652058_0_7649.html
项目类型:
学科类型:
论文1v1指导