大豆CML家族基因的生物信息学分析

• 作者: 刘艾林 朱丹 朱延明 端木慧子 肖佳雷 陈超
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 CMLs EF-hand 生物信息学 进化分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 957-963
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2015.06.0957

摘要

CMLs蛋白是一类具有Ca2+结合的EF-hand保守结构域蛋白,广泛参与钙依赖的信号传导途径,在植物生长发育及生物胁迫与非生物胁迫响应中起着重要的作用.通过NCBI和植物基因组注释数据库等筛选并获得了68个大豆GmCML蛋白;分析了所有蛋白的基本特性;通过与拟南芥伪化s基因的进化树分析表明,GmCML家族基因属于8个亚类;对GmCML家族基因进行了染色体定位与重复基因进化关系分析,发现其具有较高的进化速率;序列比对发现GmCML类蛋白含有2～4个保守的EF-hand结构域;利用芯片数据对野生大豆在碱胁迫下的叶和根中的CMLs基因表达模式进行了分析,得到26个GsCML基因在碱胁迫下有显著的差异表达,且在根和叶中的差异表达模式不同,表明这些基因参与植物碱胁迫应答,且具组织表达特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱延明	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	125	1696	22.0	34.0
2	刘艾林	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	5	34	4.0	5.0
3	陈超	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	19	120	7.0	10.0
4	肖佳雷	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	13	103	5.0	9.0
5	端木慧子	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	5	43	4.0	5.0
6	朱丹	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	3	38	3.0	3.0