基于DNA条形码的玉叶金花属植物鉴定研究

• 作者: 刘婉桢 涂铁要 邓小芳 陈湜 龚维
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 玉叶金花属 DNA条形码 物种鉴定 matK trnH-psbA rbcL ITS ITS2
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 727-732
• 分类号: R282.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.05.019

摘要

目的 利用DNA条形码进行玉叶金花属植物的分子鉴定.方法 对玉叶金花属20种、89份个体进行叶绿体片段rbcL、matK和trnH-psbA以及核基因片段ITS的PCR扩增和测序,计算种内和种间Kimura 2-parameter(K2-P)遗传距离,利用序列相似性法和邻接法进行单一片段、核心片段、组合片段以及ITS2片段的分析.结果 单一片段分析结果表明玉叶金花属种间遗传距离(0.002～0.012)明显大于种内遗传距离(0.000 3～0.000 7).trnH-psbA扩增率最低,ITS2片段的分辨率最高,其次是matK和ITS片段,rbcL片段的分辨率最低.片段组合后的分辨率明显提高,基于序列相似性法和邻接法,matK+ rbcL+ ITS和matK+ rbcL+ trnH-psbA+ ITS的分辨率相当,且比其他片段组的分辨率更高,分别为77％和75％,成功鉴定了15个近缘类群,包括2个药用种类广西玉叶金花和藕花.结论 鉴于trnH-psbA扩增率较低,建议matK+ rbcL+ITS作为玉叶金花属物种鉴定的DNA条形码,并作为其药用种类的分子鉴定工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓小芳	国家林业局管理干部学院	7	14	3.0	3.0
2	龚维	华南农业大学生命科学学院	4	23	2.0	4.0
3	陈湜	福建农林大学益虫研究所	2	5	2.0	2.0
4	刘婉桢	华南农业大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0
5	涂铁要	中国科学院华南植物园中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室	1	3	1.0	1.0