甘蓝型油菜BnFAD2-C1基因全长序列的克隆、表达及转录调控元件分析

• 作者: 刘睿洋 刘芳 官春云 彭烨
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 BnFAD2-C1基因 RACE 生物信息学分析 茉莉酸
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 1663-1670
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.01663

摘要

脂肪酸去饱和酶基因(FAD2)是控制植物体中油酸含量的关键基因,在甘蓝型油菜中有4个FAD2基因的拷贝,分别定位在A1、C1、A5、C5染色体上。本文克隆了1个FAD2拷贝基因,依据油菜基因组数据库信息,将其定位到C1染色体上,命名为BnFAD2-C1,其开放阅读框为1155 bp。采用RACE (rapid-amplification of cDNA ends)技术获得了175 bp的5￠ UTR序列和212 bp的3￠ UTR序列。采用荧光定量PCR技术研究发现,BnFAD2-C1在根、花和角果皮中仅保持本底水平的表达,在种子发育中期呈现高效表达,具有种子特异性诱导表达的特征。根据甘蓝和油菜基因组数据库信息,同源克隆到BnFAD2-C1基因的启动子(promoter)和内含子(intron)序列,并通过PLACE和PlantCARE网站分析,初步预测到调控该基因转录的潜在顺式作用元件。通过茉莉酸诱导处理, BnFAD2-C1基因表达量发生变化,推断茉莉酸在BnFAD2-C1基因的表达过程中可能发挥一定的调控作用。