珠江流域野生黄颡鱼 Pelteobagrus fulvidraco 的Cyt b基因序列分析

• 作者: 刘丽 孙际佳 张鹤千 李桂峰 杨子拓 杨慧荣 肖诗斌 谢堂晖 赵会宏 韩兴鹏
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 黄颡鱼 珠江流域 遗传多样性 Cyt b
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 页码范围: 102-108
• 页数: 7页
• 分类号: Q953.5
• 字数: 6030字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13471/j.cnki.acta.snus.2015.05.020

摘要

利用 PCR 技术扩增得到珠江水系5个江段共190尾野生黄颡鱼 Pelteobagrus fulvidraco 样品的线粒体DNA 细胞色素 b （Cyt b）基因片段，并测定其序列，确定野生黄颡鱼的 Cyt b 基因片段全长为1109 bp。在190尾样品中检测到43种不同的单倍型，单倍型多样性（Hd ）和核苷酸多样性（Pi ）分别为0.84857和0.04817，呈高单倍型、低核苷酸多样性的分布模式，表明其遗传多样性属于中等水平。利用 Clustal-X 1.81和 MEGA 5.0软件对190尾样品进行同源基因序列分析，其 A ＋T 含量（55.1％）显著高于 G ＋C 含量（44.8％），碱基组成差异不大，分布比较平均。使用最大似然率法构建分子系统发生树，结果表明都匀江段与左江江段的遗传分化程度最大（Fst ＝0.41430）。AMOVA 分析显示，珠江水系野生黄颡鱼的遗传变异均来自群体内，达到75.23％，表明地理因素对黄颡鱼的遗传分化产生了一定的影响，聚类结果与地理分布存在一定的相关性。中性检验结果表明，各群体间没有发生过种群扩张，种群数量相对稳定。