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玉米BEL1-like基因家族的鉴定、表达和调控分析
玉米BEL1-like基因家族的鉴定、表达和调控分析
作者:
孙伟
张丹
张祖新
曹征
李曼菲
原文服务方:
作物学报
BEL1-like基因家族
基因表达
系统发育分析
顺式作用元件
摘要:
BEL1-like (BELL)家族蛋白是植物中普遍存在的一类具有同源异型结构域的转录因子。拟南芥中BELL家族蛋白能与KNOTTED1-like蛋白互作形成异源二聚体,并结合到特异顺式作用元件来调控基因的表达,从而影响植物生长发育进程。本文采用隐马可夫(HMM)模型,在玉米基因组中鉴定到15个BELL家族基因(ZmBELL),分布于7条玉米染色体。通过与拟南芥BELL基因的序列比较将这些基因分为两大类。在玉米8种组织中ZmBELL有不同的表达模式,具有明显的组织表达特异性。基于基因共表达分析及 BELL-like 蛋白特异结合的顺式元件分析,预测到86个可能受ZmBELL调控的下游靶标基因。这86个基因和12个ZmBELL表达模式相同,并且在基因启动子区存在与BEL1-like蛋白结合的顺式元件。这些结果为进一步解析玉米BELL家族基因的功能和作用机制积累了有价值的资料。
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篇名
玉米BEL1-like基因家族的鉴定、表达和调控分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
BEL1-like基因家族
基因表达
系统发育分析
顺式作用元件
年,卷(期)
2015,(11)
所属期刊栏目
作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
研究方向
页码范围
1632-1639
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2015.01632
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张祖新
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
17
182
7.0
13.0
3
张丹
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
4
10
2.0
3.0
4
曹征
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
1
5
1.0
1.0
5
李曼菲
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
1
5
1.0
1.0
6
孙伟
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
2
5
1.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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BEL1-like基因家族
基因表达
系统发育分析
顺式作用元件
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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