红笛鲷 M APKK5 基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 冯东岳 吴灶和 焦茂兴 简纪常 蔡佳 鲁义善 黄郁葱
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 红笛鲷 MAPKK5 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 288-293
• 页数: 6页
• 分类号: Q781
• 字数: 3943字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16378/j.cnki.1003-1111.2015.05.004

摘要

利用本实验室构建红笛鲷头肾cDNA文库中的 MAPKK5基因 EST 序列 ,通过 RACE PCR技术克隆红笛鲷MAPKK5基因cDNA全长(Ls-MAPKK5 ,登录号为KM657202).序列分析结果显示 ,Ls-MAPKK5 cDNA全长2632 bp ,其中开放阅读框1317 bp ,可编码438个氨基酸 ,预测其编码蛋白的分子量为49 .29 ku ,理论等电点为6 .12.SignalP 4 .0 、TMHMM Server 2 .0和SoftBerry-Psite预测结果显示 ,Ls-MAPKK5没有信号肽和跨膜结构 ,含有22个磷酸化位点.氨基酸序列分析显示Ls-MAPKK5具有保守的PB1与S_TKc结构域.利用MEGA5 .0软件 ,根据邻位相连法构建MAPKK5系统进化树 ,结果显示Ls-MAPKK5与雀鲷、吉富罗非鱼该蛋白有较近的亲缘关系.