甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析

• 作者: 于景印 刘胜毅 刘越英 唐敏强 程晓晖 童超波 董彩华 赵传纪 马小艮 黄军艳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 全基因组关联分析 SNP 株高 候选基因
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1121-1126
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.01121

摘要

适当的株高不仅是抗倒性和机械化收获的需要,而且是建立高产理想株型的需要。本研究测定来自世界油菜主产国的371份种质资源材料构成的自然群体的株高,利用60K SNP芯片对该群体进行基因型检测,获得了21856个SNP,利用这些 SNP 和株高数据进行全基因组关联分析,结果表明：(1)检测到4个与株高显著关联的 SNP,即 Bn-A07-p3583161、Bn-scaff_22790_1-p1271170、Bn-scaff_20735_1-p42779和Bn-scaff_18702_1-p589589,分别分布于A07、C01和C02染色体；它们对表型变异的解释率分别为11.33%、11.75%、12.31%和10.97%；(2)参考基因组信息,在上述前3个SNP附近的492.0、9.5和69.5 kb处分别找到一个与株高性状相关的候选基因；(3)4个显著SNP各自的等位基因间表型均值差异分别为11.09、15.12、10.48和8.93 cm,双尾t测验结果表明各等位基因组间差异显著。