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摘要:
为研究牦牛(Bos grunniens)热休克蛋白70-12B基因(heat shock 70 kD protein-12B,HSPA12B)的序列特性及其在体外受精胚胎中的表达情况,本研究根据黄牛(Bos taurus)HSPA12B基因序列5'端和3'端的保守序列设计特异性引物,RT-PCR扩增之后通过基因克隆得到HSPA12B基因(GeneBank登录号:KR258751),利用生物学信息软件对其进行生物学信息分析,并采用实时定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)检测其在牦牛体外受精胚胎2-4细胞期、5-8细胞期、桑葚期、囊胚期4个不同时期胚胎中的表达水平.生物学信息分析结果显示,牦牛HSPA12B基因序列具有一个长705 bp的编码区,可编码234个氨基酸,其中丙氨酸(Ala)含量最高(10.3%),天冬酰胺(Asn)含量最少(0.9%);同源性和系统进化树分析显示,牦牛HSPA12B基因与黄牛HSPA12B的同源性最高,为99.5%,表明HSPA12B在进化中具有高度保守性;编码产物无信号肽,为非跨膜蛋白,不属于分泌蛋白,整体表现为亲水性.qRT-PCR检测结果显示,HSPA12B在牦牛体外受精2-4细胞期胚胎、5-8细胞期胚胎、桑椹胚和囊胚中均有表达;HSPA12B在2-4细胞期胚胎中的相对表达量分别是在5-8细胞期胚胎、桑椹胚和囊胚中相对表达量的14.814 8、4.269 9和40.485 8倍;HSPA12B在2-4细胞期胚胎中的相对表达量,均与在5-8细胞期胚胎、桑椹胚和囊胚中的相对表达量差异性极显著(P<0.01).本研究提示,HSPA12B在牦牛体外受精胚胎的发育过程中非常重要,可能起着抑制细胞凋亡,延缓细胞衰老,调控胚胎早期发育的作用.
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内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 牦牛热休克蛋白70-12B基因(HSPA12B)的克隆及其在体外受精胚胎中的表达
来源期刊 农业生物技术学报 学科
关键词 牦牛 热休克蛋白70-12B基因(HSPA12B) 基因克隆 生物信息学分析 体外培养(IVF) 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)
年,卷(期) 2015,(9) 所属期刊栏目 专题:牦牛生殖调控与发育免疫
研究方向 页码范围 1226-1233
页数 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.09.012
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 余四九 甘肃农业大学动物医学院 165 736 11.0 19.0
2 樊江峰 甘肃农业大学动物医学院 32 116 7.0 9.0
3 崔燕 甘肃农业大学动物医学院 119 412 10.0 13.0
4 刘鹏刚 甘肃农业大学动物医学院 17 34 3.0 5.0
5 潘阳阳 甘肃农业大学动物医学院 40 69 5.0 7.0
6 郑红飞 甘肃农业大学动物医学院 4 5 1.0 2.0
7 何翃闳 甘肃农业大学动物医学院 11 18 2.0 4.0
8 李秦 甘肃农业大学动物医学院 6 21 2.0 4.0
9 吕鹏 甘肃农业大学动物医学院 5 12 1.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
牦牛
热休克蛋白70-12B基因(HSPA12B)
基因克隆
生物信息学分析
体外培养(IVF)
实时荧光定量PCR(qRT-PCR)
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
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8
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40364
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