hsa-miRNA-451靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 李筱荣 邵彦 陈振娜
• 来源期刊: 中华眼底病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 基因疗法 预测 计算生物学 糖尿病视网膜病变/病理生理学
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 文献计量学
• 页码范围: 597-599
• 页数: 3页
• 分类号: R774.1
• 字数: 3031字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1005-1015.2015.06.022

摘要

目的 对hsa-miRNA-451进行靶基因预测及相关生物信息学分析.方法 选择miRBase、miRanda、TargetScan、PicTar数据库或预测软件预测hsa-miRNA-451靶基因.对预测的hsa-miRNA-451靶基因的基因集合进行功能富集分析和信号转导通路富集分析.采用Fisher精确概率法计算P值,P＜0.05为显著性阈值.结果 至少3个数据库或预测软件预测到hsa-miRNA-451靶基因的靶点18个.功能富集分析预测的结果显示,hsa-miRNA-451靶基因主要参与上皮细胞增生、发育以及调节酶活性相关生物过程(p＜0.05).信号转导通路富集分析预测的结果显示,has-miRNA-451靶基因显著富集于转化生长因子-β信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、表皮生长因子信号通路、Wnt信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路等(P＜0.05).结论 hsa-miRNA451可调控与上皮细胞增生、发育相关的多个信号通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李筱荣	天津医科大学眼视光学院	147	707	12.0	19.0