光谱法及分子模拟法研究杨梅素与ct-DNA的相互作用

• 作者: 何华 朱鸣阳 李悦 肖得力
• 来源期刊: 分析测试学报
• 学科: 化学
• 关键词: 杨梅素 小牛胸腺DNA (ct-DNA) 沟槽结合 光谱法 分子模拟
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1233-1239
• 页数: 7页
• 分类号: O657.3|Q523
• 字数: 5586字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4957.2015.11.004

摘要

采用紫外光谱、荧光光谱结合亚甲基蓝荧光探针(MB)、圆二色谱(CD)以及分子模拟等技术研究了生理条件下杨梅素与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用,探索了其可能的结合位点与作用机制.热力学参数显示△H＜0、△S ＜0,说明杨梅素与ct-DNA通过氢键和范德华力发生相互作用.光谱研究显示,ct-DNA能够猝灭杨梅素的内源荧光,猝灭方式为静态猝灭,两者的结合常数为1.86×103 mol",结合位点数为1.在竞争性实验中杨梅素未能将MB从MB-DNA复合体系中游离出来,说明其与ct-DNA的作用方式为沟槽结合.圆二色光谱研究表明,杨梅素的加入未能破坏ct-DNA的双螺旋结构,两者的作用方式为沟槽结合.进一步通过分子模拟研究得到杨梅素与DNA结合的最低能量构象,杨梅素A环7-O和B环3'-O分别与DNA的碱基DA18和DA6在边缘小沟处通过氢键结合,周围富含碱基A和T,与光谱学研究结果一致,结合距离分别为2.061 A和1.918 A.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何华	中国药科大学分析化学教研室	90	635	12.0	21.0
2	李悦	天津医学高等专科学校药学与医学检验技术系	8	15	3.0	3.0
3	朱鸣阳	中国药科大学分析化学教研室	2	4	1.0	2.0
4	肖得力	中国药科大学分析化学教研室	6	41	4.0	6.0