鸡T细胞受体γ链基因位点重新测序和组装

• 作者: 刘飞 律娜 朱宝利 杨犀 陈燕 马俊平
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 鸡 T细胞受体(TCR) 伽马链(TCRγ或TRG)基因位点 测序 组装
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 568-574
• 页数: 7页
• 字数: 5903字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.14-382

摘要

动物T细胞受体(T cell receptor,TCR)基因由多个不同的高度同源的基因家族组成,通过全基因组测序很难获得准确的基因序列和排列位置.文章通过在NCBI中发布的鸡TCR的γ链(TCRγ或TRG)基因片段序列定位了鸡TRG基因所在区域,并确定了与鸡TRG基因位点对应的细菌人工染色体(BAC)克隆(CH261-174P24).对该克隆进行高通量的重新测序和组装后,得到含有10个scaffolds的基因组草图,较完整地覆盖了鸡TRG基因位点及两侧区域.通过PCR扩增和测序证明了scaffold内部结构的正确性,校正了鸡参考基因组TRG基因位点一个可变基因和一个缺口序列(gap)附近各一处错误序列,以及可变基因区多处序列错误.文章通过校正鸡参考基因组TRG基因位点的序列,为鸡TRA/D和TRB基因位点的基因组序列分析提供了新方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘飞	中国科学院微生物研究所	71	509	12.0	19.0
2	朱宝利	中国科学院微生物研究所	27	187	9.0	13.0
3	律娜	中国科学院微生物研究所	9	68	4.0	8.0
4	马俊平	中国科学院微生物研究所	1	0	0.0	0.0
8	杨犀	中国科学院微生物研究所	3	24	2.0	3.0