2010～2013年聊城地区肠道病毒A组CVA16型VP1基因特征及手足口病流行特点分析

• 作者: 丁淑军 刘莉 张芙蓉 徐可心 杜银菊 王建醒 王飞 裴耀文 赵宪敬
• 来源期刊: 预防医学论坛
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 CVA16型肠道病毒 VP1基因 流行特征
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 801-805,808
• 页数: 6页
• 分类号: R512.5
• 语种: 中文

摘要

目的 对引起聊城地区手足口病(HFMD)流行的肠道病毒CVA16进行生物学分析,掌握其基因特征,为聊城地区手足口病的防控提供病原学资料.方法 对2010～2013年聊城市各辖区采集手足口病患儿标本采用Real-time PCR法检测肠道病毒CVA16,用人横纹肌瘤(RD)细胞对核酸检测阳性标本进行病毒分离,对分离到的CVA16病毒分离株采用RT-PCR方法进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,利用DNAStar和MEGA 4.0分析软件进行同源性分析和构建系统进化树.结果 2010～2013年聊城市各辖区共送检手足口病标本862份,639份标本检测为通用肠道病毒核酸阳性,其中CVA16阳性标本181份,分离到109株毒株;对毒株进行基因序列分析显示,2010～2013年聊城市流行的CVA16病毒株为B1基因型,2010和2011年为B1a和B1b两种基因亚型共循环,2012和2013年为B1b型,不同毒株VP1区基因序列在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为91.0％～97.0％和98.3％～100％,与近源的亚型代表株相比,聊城市优势毒株的氨基酸变异一般发生在VP1第23位(L→M).结论 聊城市2010～2013年手足口病CVA16流行毒株为B1基因型,存在B1a、B1b两个基因亚型,同源性分析表明辖区部分CVA16分离株B1a亚型与我国台湾及周边国家的分离株关系较近,B1b亚型与来自国内北方分离株形成进化树上关系较近的一群.聊城市存在不同的传播链,流行的CVA16相对保守,但已出现一定程度的变异.