甘蓝型油菜株高、第一分枝高和分枝数的QTL检测及候选基因筛选

• 作者: 刘列钊 曲存民 李加纳 王嘉 荆凌云 荐红举 谌利
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 单核苷酸多态性 数量性状位点 株高 第1分枝高度 分枝数
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 1027-1038
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.01027

摘要

株高、分枝数及第1分枝高是油菜重要的农艺性状。本研究利用甘蓝型油菜GH06和P174杂交, F2通过单粒法连续自交至F11构建重组自交系群体,利用油菜60K芯片对该群体进行基因分型,构建高密度遗传连锁图谱。结果表明,该图谱包含2795个SNP多态性标记位点,总长1832.9 cM,相邻标记间平均距离为0.66 cM。在此图谱基础上采用复合区间作图法(CIM),检测到3个农艺性状的24个QTL。其中11个株高QTL分别位于A01、A06、A07、A08、A10和C06染色体,单个QTL解释5.00%~15.26%的表型变异；7个第1分枝高QTL分别位于A06、C05和C06染色体,单个QTL解释5.04%~12.99%的表型变异；6个分枝数QTL分别位于A03、A07、C01、C04和C06染色体,单个 QTL解释5.95%~8.14%的表型变异。将156个拟南芥株高相关基因、10个拟南芥第1分枝高相关基因和148个拟南芥分枝数相关基因与 QTL 对应置信区间序列进行同源比较分析(E<1E–20),分别找出了20个株高候选基因、3个第1分枝高候选基因以及12个分枝数候选基因。2个环境中在A07染色体上重复检测到的QTL置信区间检测到与株高相关的候选基因 ATGID1B/GID1B 和 WRI1, A08染色体上重复检测到的 QTL 置信区间检测到 SLR/IAA14和AXR2/IAA72个与株高相关的候选基因。在具有部分置信区间重叠的q2013FBH-C05-1和q2014FBH-C05-2区间均检测到第1分枝高候选基因PHT1；8,在A03和C06染色体上的QTL置信区间内,分别检测到4个分枝数候选基因,匹配E值介于0~3E–56之间。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘列钊	西南大学农学与生物科技学院	14	394	9.0	14.0
2	李加纳	西南大学农学与生物科技学院	82	981	17.0	28.0
3	谌利	西南大学农学与生物科技学院	29	369	11.0	18.0
4	王嘉	西南大学农学与生物科技学院	6	54	5.0	6.0
5	曲存民	西南大学农学与生物科技学院	9	112	7.0	9.0
6	荐红举	西南大学农学与生物科技学院	4	27	3.0	4.0
7	荆凌云	西南大学农学与生物科技学院	1	14	1.0	1.0