禾谷炭疽菌磷酸二酯酶生物信息学分析

• 作者: 韩长志
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 农学
• 关键词: 禾谷炭疽菌 磷酸二酯酶 理化性质 亚细胞定位 二级结构
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 268-274
• 页数: 7页
• 分类号: S763.15
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.03.055

摘要

[目的]磷酸二酯酶(Pde)作为G蛋白信号传导途径上的效应酶,发挥着重要作用.该酶已在粟酒裂殖酵母菌、稻瘟病菌等中有相关报道.通过对禾谷炭疽菌中Pde生物信息学分析,以期为深入开展该蛋白定位、功能研究等方面研究,以及实现以控制病原菌G蛋白信号途径功能新的药物靶标的开发提供有力的理论支撑.[方法]基于酿酒酵母中已经报道的典型Pde序列,利用Blastp以及关键词对禾谷炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,并通过SMART保守结构域分析、理化性质、疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,此外,通过对禾谷炭疽菌中的典型Pde与其他物种中的同源序列进行遗传关系比较分析.[结果]明确禾谷炭疽菌中存在2个Pde,上述Pde均含有最低比例的色氨酸,均属于亲水性蛋白,均不含有信号肽以及均定位于细胞质等特征.[结论]通过对比,发现禾谷炭疽菌、酿酒酵母中的Pde具有诸多相同性质,提示不同真菌之间存在的保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩长志		74	325	9.0	16.0