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绿盲蝽TRPA1基因的鉴定及功能分析
绿盲蝽TRPA1基因的鉴定及功能分析
作者:
付婷
刘杨
杨婷
王桂荣
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
绿盲蝽
TRPA1
温度
爪蟾卵母细胞
双电极电压钳
摘要:
【目的】克隆绿盲蝽(Apolygus lucorum)TRPA1基因,明确其在成虫不同组织中的表达分布,研究绿盲蝽TRPA1基因的功能,阐明绿盲蝽感受温度的分子基础。【方法】在绿盲蝽转录组测序的基础上,通过生物信息学方法分析转录组数据,得到编码绿盲蝽 TRPA1基因的 cDNA 序列片段。根据已知的 cDNA 序列,设计引物。采用RT-PCR及RACE(rapid-amplification of cDNA ends)技术克隆TRPA1基因的全长序列,并通过DNAMAN软件及BLAST分析测序结果。测序正确后,使用在线工具SMART及TMpred预测TRPA1蛋白的锚蛋白重复序列(Ankyrin repeats)及跨膜结构域序列。通过序列比对,构建昆虫TRP(transient receptor potential)通道的家族进化树,分析绿盲蝽TRPA1与其他物种同源基因的相似性及进化地位。以GADPH为内参基因,利用RT-PCR检测绿盲蝽TRPA1在成虫触角、头、喙、足、腹等不同组织中的相对表达量。通过爪蟾卵母细胞体外表达结合双电极电压钳记录技术研究绿盲蝽TRPA1对温度刺激的反应。【结果】通过绿盲蝽转录组数据预测得到TRPA1基因的4个cDNA序列片段,经过RT-PCR及RACE技术克隆得到了绿盲蝽TRPA1的全长序列,并命名为AlucTRPA1。AlucTRPA1开放阅读框全长3672 bp,编码1223个氨基酸。通过在线工具SMART及TMpred预测分析结果表明,AlucTRPA1含有16个锚蛋白重复序列结构及6个保守的跨膜结构域。序列比对及进化树分析结果显示,昆虫TRPA家族包含TRPA1、Painless、Pyrexia及Water witch,AlucTRPA1属于昆虫TRPA1亚家族。AlucTRPA1与其他昆虫的同源基因具有很高的相似性,特别是与同属半翅目的豌豆蚜(Acyrthosiphon pisum)的同源性高达65.1%。成虫组织表达谱分析结果表明,AlucTRPA1在成虫触角中的表达量最高,头、喙、足、腹中也都有表达。爪蟾卵母细胞体外表达结合双电极电压钳记录结果表明20℃至40℃逐渐上升的温度可以直接激活AlucTRPA1通道,且两次连续重复的温度刺激未引起AlucTRPA1通道的钝化。【结论】AlucTRPA1在绿盲蝽成虫的触角、头等组织中均有表达,且在爪蟾卵母细胞表达的AlucTRPA1能被20℃至40℃逐渐上升的温度刺激直接激活,推测AlucTRPA1在绿盲蝽体内是直接的温度感受器,参与调控绿盲蝽对生活环境温度的感知行为。
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文献信息
篇名
绿盲蝽TRPA1基因的鉴定及功能分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
绿盲蝽
TRPA1
温度
爪蟾卵母细胞
双电极电压钳
年,卷(期)
2015,(12)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
2364-2373
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2015.12.009
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
王桂荣
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
48
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14.0
27.0
2
刘杨
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
35
287
10.0
16.0
3
杨婷
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
9
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4.0
9.0
4
付婷
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
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2016(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
绿盲蝽
TRPA1
温度
爪蟾卵母细胞
双电极电压钳
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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