莆田豆梨 GPX 基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 张长和 陈义挺 陈婷 陈招弟
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 地方种质资源 豆梨 GPX基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 868-873
• 页数: 6页
• 分类号: S661.2
• 字数: 4205字
• 语种: 中文

摘要

采用同源克隆 RT-PCR 结合 RACE 技术，从福建省地方梨种质资源莆田豆梨中克隆出 GPX 基因的cDNA 全长序列分离克隆并运用生物信息学方法对序列进行分析。克隆得到福建省地方种质资源莆田豆梨 GPX基因932 bp 的 cDNA 全长序列，分析表明，该序列的5′端和3′端的非编码序列长度分别为204 bp 和221 bp，开放阅读框为507 bp，编码168个氨基酸。氨基酸序列与苹果、柑橘、龙眼、荔枝的同源性90％以上。GPX 基因在 GenBank 上登录，登录号为 JQ011278。生物信息学分析表明：GPX 蛋白的分子量是20083．0 Da，理论等电点 pI 5．61，是不具跨膜结构域的亲水性胞质蛋白，不具有信号肽，细胞主要定位在细胞质上，有1个区域最有可能形成卷曲螺旋，由26．58％的 a 螺旋，19．26％的延伸链和54．16％的不规则卷曲组成，磷酸化位点有12个。此外，还对 GPX 酶分子三维立体结构等进行预测和分析。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈婷	福建省农业科学院果树研究所	60	216	8.0	12.0
2	张长和		23	74	5.0	7.0
3	陈义挺	福建省农业科学院果树研究所	62	358	11.0	15.0
4	陈招弟	福建省农业科学院果树研究所	3	21	2.0	3.0