美洲水貂(Neovison vison)黑素皮质激素受体-1(MC1R)基因序列鉴定及生物信息学分析

• 作者: 丛波 刘琳玲 宋兴超 岳志刚 徐超 杨福合 王雷
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 美洲水貂 黑素皮质激素受体-1基因 皮毛颜色 跨膜区 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 752-759
• 页数: 8页
• 分类号: S865.22
• 字数: 6147字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.05.010

摘要

旨在探明美洲水貂黑素皮质激素受体-1(Melanocortin-1 receptor,MC1R)基因序列结构特征及其对皮毛颜色的调控机制.根据欧洲水貂MC1R基因(GenBank登录号:AB189820)核苷酸序列设计1对特异性引物,利用PCR及克隆技术测定美洲短毛黑水貂MC1R基因完整编码区序列(CDS),并对该序列进行了BLAST比对及生物信息学预测和分析.结果表明,获得的美洲水貂MC1R基因与欧洲水貂相似性为95％,为单一外显子基因,核苷酸序列长度为1 324 bp,包括部分5'UTR(188 bp)、CDS(954 bp)和3'UTR(182 bp),编码区碱基G+C含量高达66.04％,由CDS推导共编码317个氨基酸,预测的MC1R蛋白理论分子质量为34.49 ku,等电点(PI)为8.97,不稳定系数是36.63,属于弱碱性稳定蛋白质.进一步分析发现,美洲水貂MC1R基因编码的蛋白存在1个低复杂度结构域和7个典型的跨膜区,N-端不存在信号肽,定位于细胞质膜,具有典型的细胞膜受体结构.分子进化分析显示,美洲水貂与欧洲水貂亲缘关系较近,与二者均属鼬科、鼬属动物的传统动物分类学一致.美洲水貂MC1R基因的获取及序列结构特征分析为揭示其皮毛颜色多样性的分子遗传学机制奠定了详细的生物信息学基础.