人线粒体转录延伸因子蛋白结构与功能的生物信息学分析

• 作者: 孙美涛 张晓娟 张海洋 李雅 杨勇琴 熊伟
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 人 线粒体转录延伸因子 生物信息学 结构与功能
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 474-480
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.05.0094

摘要

[目的]基于生物信息学方法分析人线粒体转录延伸因子TEFM蛋白的结构和功能.[方法]检索Uniprot数据库中人线粒体转录终止因子TEFM蛋白的氨基酸序列,利用生物信息学方法对人TEFM的理化性质、物种间的蛋白质同源性、跨膜区、亲水性/疏水性、亚细胞定位、蛋白质二级结构、保守结构域、蛋白质三级结构、蛋白质相互作用进行预测与分析.[结果]人TEFM全长360个氨基酸,理论等电点9.39,属于TEFM蛋白超家族,不含跨膜区,属于亲水蛋白;人TEFM含有一个保守的螺旋-发夹-螺旋(HHH_3)结构域,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维建模空间结构与二级结构预测结果相符,进一步分析建模结果可靠.与人TEFM相互作用的蛋白质均为线粒体DNA转录因子或线粒体RNA聚合酶.[结论]人TEFM具有线粒体转录延伸因子蛋白超家族的典型结构,生物信息学分析结果对深入研究人TEFM在线粒体基因转录调控中的作用具有一定的理论指导意义.