长江刀鲚体内菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性比较分析

• 作者: 徐钢春 杜富宽 沈芬华 聂志娟 顾若波 黄敏康
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: PCR-DGGE 长江刀鲚 洄游 香农指数 细菌菌落
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 三峡水库渔业资源与环境
• 页码范围: 1019-1026
• 页数: 8页
• 分类号: Q938.8
• 字数: 4446字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2015.133

摘要

以长江刀鲚(Coilia nasus)洄游前幼鱼和洄游后成鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术探讨长江刀鲚菌群多样性及受洄游路径周围环境影响之后的稳定性.结果显示,PCR-DGGE指纹谱带丰富,共显示出70条可鉴别条带,其中长江水体谱带数(28)高于洄游后刀鲚鳃(26)、胃(26)、肠道壁(20)、肠道内容物(21)和洄游前刀鲚鳃(21)、胃(20)、肠道壁(11)、肠道内容物(13),洄游后刀鲚成鱼体内各对应部位菌群数显著高于洄游前刀鲚幼鱼.UPGMA聚类和PCA结果显示不同样品之间差异显著,虽长江水体与洄游后刀鲚鳃、胃及肠道内容物样品在聚类图上聚为一簇,但其菌群结构的相似度较低,分别为43％、35％和28％.成功克隆测序其中43条条带,主要包含α-变形菌(25.6％)、p-变形菌(7％)、丫-变形菌(16.3％)、放线菌(25.6％)、厚菌门(9.3％)、拟杆菌(7％)、柔膜菌门(4.6％)、绿弯菌(2.3％)和未定义菌(2.3％).以上结果表明长江刀鲚体内不同部位及其在洄游前后不同阶段,菌群结构存在显著差异,并受环境和宿主双层因素影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐钢春	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	80	752	16.0	23.0
2	杜富宽	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	13	86	7.0	9.0
3	聂志娟	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室	19	111	7.0	10.0
4	黄敏康	南京农业大学渔业学院	1	3	1.0	1.0