海洋细菌胞外蛋白酶PPC结构域序列特性与系统进化分析

• 作者: 何海伦 刘丹 吴日帮 杨兴昊 武翠玲 黄嘉丰
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白酶 PPC结构域 保守区 系统进化树 基因水平转移
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 13-23
• 页数: 11页
• 分类号: Q93
• 字数: 7314字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20140519002

摘要

PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛分布于分泌型海洋细菌蛋白酶的 C 末端，对蛋白酶的分泌，锚定及与底物相互吸附起到重要作用。对 PPC 结构域序列分析发现， PPC 结构域存在两个较为保守序列区，且这两个保守区空间结构为β-折叠。尽管有的PPC结构域序列一致性较低，但不同结构域间存在相同的保守序列，且其三维结构相似。为了进一步对不同来源的PPC结构域的进化关系进行系统研究，本研究选取公开发表的PPC结构域，通过在 NCBI数据库中搜索得到61条来自于39个细菌所分泌的不同蛋白酶的PPC的氨基酸序列进行系统发育分析。发现PPC结构域在生物进化过程中序列变异性大，保守性弱。其中，有些细菌PPC结构域可能来源于自身基因重复产生，有些细菌PPC结构域则可能由水平基因转移产生。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丹	中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室	107	673	12.0	19.0
2	何海伦	中南大学生命科学学院 医学遗传学国家重点实验室	5	22	2.0	4.0
3	黄嘉丰	中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
4	杨兴昊	中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
5	吴日帮	中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
6	武翠玲	中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室	1	1	1.0	1.0