3种泥鳅微卫星标记和D-Loop部分序列遗传变异分析

• 作者: 傅建军 姜虎成 徐如卫 李家乐 杨福生 薛婷
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 泥鳅 大鳞副泥鳅 微卫星 D-Loop序列 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 页码范围: 465-474
• 分类号: Q785|S965
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20141009529

摘要

为进一步了解中国当前主要养殖鳅类种质资源现状,实验采用7个微卫星标记和线粒体D-Loop部分序列,对泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus,MA)、大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus,PD)和台湾大泥鳅(未见种属分类,TW)3种泥鳅进行群体遗传变异分析.结果显示,6个微卫星位点在3种泥鳅中均能获得有效扩增,1个微卫星标记(Mac239)只在MA中获得特异性扩增,而在PD和TW中未能获得有效扩增条带.在3种泥鳅共90尾个体的D-Loop 部分序列中发现32个单倍型,仅在PD和TW间存在1个共享单倍型.实验中共检测到65个变异位点,其中MA与PD和TW间存在29个特异性位点,而PD和TW间未检测到特异性位点.瓶颈效应和中性检验显示,TW近期可能发生有效群体数量的减少.基于微卫星标记和D-Loop部分序列的遗传变异分析显示,TW和PD间的Nei's遗传距离和K2P遗传距离最近(0.297和0.006),明显小于两者与MA间的遗传距离(1.011～1.899和0.095～0.099);分子方差分析(AMOVA)显示,3种泥鳅的遗传分化极显著(P＜0.01).群体间遗传结构和单倍型网络分析显示,3种泥鳅的遗传结构相对独立,仅在TW和PD间存在一定程度的遗传结构混杂.研究表明,泥鳅和大鳞副泥鳅在遗传结构上存在明显差异,可采用分子标记进行有效鉴别;台湾大泥鳅可能是大鳞副泥鳅的生态种群或遗传改良群体,而非有效物种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐如卫	宁波大学海洋学院	27	143	6.0	11.0
2	李家乐	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	91	1011	19.0	27.0
3	杨福生		11	75	4.0	8.0
4	薛婷	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	15	1.0	1.0
5	姜虎成	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	5	57	5.0	5.0