6种血清型鸭疫里默氏菌 SSPA 基因的克隆及序列分析

• 作者: 万春和 傅光华 傅秋玲 张丹青 施少华 程龙飞 陈红梅 黄瑜
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭 疫里默氏菌 SSPA 基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 831-835
• 页数: 5页
• 分类号: S852
• 字数: 3178字
• 语种: 中文

摘要

为了解鸭疫里默氏菌 SSPA 基因的生物学信息，参照 GenBank 登录的鸭疫里默氏菌 SSPA 基因序列设计了1对特异性引物，成功克隆6种血清型鸭疫里默氏菌 SSPA 基因，并利用生物信息学软件 DNAstar 及在线分析工具 SignalP V4．0、TM-HMM Server V．2．0、NetNGly c1．0、YinOYang 1．0和 NetPhos 2．0对推导的氨基酸序列进行分析。结果显示：该基因的 ORF 全长1692 bp，可编码563个氨基酸；氨基酸序列含有1个潜在的N-糖基化位点，1个潜在的 O-糖基化位点，以及38个潜在的磷酸化位点（包括12个丝氨酸、9个苏氨酸和17个酪氨酸位点），无跨膜区；该蛋白信号肽切割部位位于第19位的 A （丙氨酸）和第20位的 Q （谷氨酰胺）之间；6种血清型鸭疫里默氏菌 SSPA 基因的核苷酸同源性为95．7％～100．0％，氨基酸同源性为98．2％～100．0％。