为了解旱黄瓜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用黄瓜全基因组测序的450对 SSR 引物对38份旱黄瓜种质资源进行了多样性和聚类分析。结果表明:72对引物共扩增出133个等位变异,平均每个 SSR 位点的等位基因数为1.85个,变幅为1~4个。38份旱黄瓜种质资源的相异系数分布在0.215~0.704,其中6457与佳美旱黄瓜、选丰与佳美旱黄瓜、新宝与绿之秋亲缘关系较远,而 gfcs 与四季翠绿、玉翡翠与翠玉、真把握与唐山秋瓜、真把握与皇家绿秀亲缘关系较近。在阈值为0.54处,可将这38份黄瓜种质资源划分为Ⅰ、Ⅱ类。在阈值为0.48处,可将Ⅰ类再分为ⅠA、ⅠB、ⅠC 、ⅠD 4个亚类,Ⅱ类可再分为ⅡA、ⅡB、ⅡC 3个亚类。为旱黄瓜育种中亲本的选择选配提供了参考。