葡萄VvGW2基因的克隆及表达

• 作者: 余晓娟 孙海龙 宋新新 袁月 陶建敏
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 VvGW2基因 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 434-440
• 页数: 7页
• 分类号: S663.1
• 字数: 3992字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.02.033

摘要

为了从葡萄品种美人指中克隆VvGW2基因,并对其结构特征及表达模式进行分析.在NCBI中查找与水稻粒形基因OsGW2同源性最高的葡萄序列,根据葡萄的GW2基因序列设计特异引物.采用改良CTAB法提取美人指花序中总RNA,运用RT-PCR技术进行克隆.利用NCBI数据库中的BLASTn和BLASTp程序进行相似性分析;利用Bioxm2.6推测分析蛋白质分子量和等电点;根据NCBI中Conserved Domains程序进行蛋白质保守域结构预测;用ExPaSy提供的在线SOPMA程序进行蛋白质二级结构预测;利用实时荧光定量RT-PCR研究该基因表达模式.结果显示,从美人指中克隆得到1个GW2基因同源序列,命名为VvGW2基因.VvGW2基因开放阅读框长度为1 272 bp,共编码423个氨基酸,预测蛋白质分子量为46 960,理论等电点为4.68.该基因编码的氨基酸具有GW2蛋白质保守的环指结构域,该环指蛋白质为C5HC2类型.与GenBank中登录的其他植物GW2蛋白质序列相似性为47％ ～53％.根据VvGW2基因所编码的氨基酸序列构建系统进化树,结果显示,葡萄与可可聚为一类.实时荧光定量RT-PCR分析结果显示,VvGW2基因在美人指花或果实的各时期均有表达,其中在开花期基因表达量最高.不同葡萄品种中,VvGW2基因的表达量存在差异,在指形葡萄品种美人指的表达量最高,在圆形葡萄品种中的表达量很低.表明VvGW2基因在不同时期和不同品种中的表达量差异可能与葡萄果实形状相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陶建敏	南京农业大学园艺学院	118	1564	23.0	30.0
2	孙海龙	南京农业大学园艺学院	3	10	2.0	3.0
3	袁月	南京农业大学园艺学院	5	23	3.0	4.0
4	宋新新	南京农业大学园艺学院	2	31	2.0	2.0
5	余晓娟	南京农业大学园艺学院	4	31	3.0	4.0