三角帆蚌EFCB1基因cDNA序列克隆及表达研究

• 作者: 周子睿 尚攀 尚朝 施志仪 李文娟 祁晓翔
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 EFCB1 EF-hand结构域 有核珍珠 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 页码范围: 962-970
• 分类号: Q753|S914
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20141109580

摘要

为了发掘更多三角帆蚌具有EF-hand结构域的功能基因及其蛋白质,本研究运用RACE-PCR技术,克隆得到了三角帆蚌包含EF-hand结构域钙结合蛋白1基因(EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1,EFCB1)的cDNA全长并进行了生物信息学分析;通过real-time Q-PCR技术,分析了EFCB1基因在三角帆蚌10个组织,以及内脏团、外套膜插核后不同时间点的时空表达特点.结果表明三角帆蚌EFCB1基因cDNA序列全长981 bp,ORF为531 bp,编码176个氨基酸残基,5'-UTR 239 bp和3'-UTR 211 bp.EFCB1分子式为C 877 H1348 N238 O270S 10,分子量约19.9 ku,等电点为4.70,不稳定系数为62.65,属亲水蛋白.其序列无信号肽序列,存在1个跨膜区域和2个EF-hand结构域,EF-hand模块分别为DLNDDKLISPEE(98-109)和DTNGDDKLDGEE(129-140).荧光定量结果显示三角帆蚌EFCB1基因在各组织中均有表达,其中在肠和鳃中表达量最高(P＜0.05),外套膜中表达量显著高于内脏团(P＜0.05).EFCB1基因在插核后不同时期的外套膜和内脏团育珠部位组织中表达具有显著差异(P＜0.05),在外套膜中的表达量均显著高于内脏团(P＜0.05),在插核后第20天时表达量显著高于各时期(P＜0.05).研究表明,EFCB1在三角帆蚌Ca2+的吸收过程中发挥调节作用,在珍珠囊形成过程中以及珍珠形成初期具有重要功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李文娟	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	16	83	6.0	8.0
2	祁晓翔	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	3	17	3.0	3.0
3	尚朝	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	4	12	2.0	3.0
4	周子睿	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	4	12	2.0	3.0
5	尚攀	上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	3	6	1.0	2.0