多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用

• 作者: 刘祥 周阳 孙松松 熊衍文 王斌 王红 肖波 许彦梅 邓建平
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 多位点序列分型技术(MLST) 艾伯特埃希菌 新病原
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1033-1036
• 页数: 4页
• 分类号: R378
• 字数: 2749字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2015.11.009

摘要

目的 探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用.方法 采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析.结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异.结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在.