AMHR2新型转录本AMHR2-SV1的鉴定及其在大鼠组织中的表达

• 作者: 徐明龙 徐银学 牛亚茹 郭保平
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: AMHR2 AMHR2-SV1 新型转录本 表达图谱
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 394-400
• 页数: 7页
• 分类号: Q786
• 字数: 4064字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.02.027

摘要

本研究旨在鉴定抗苗勒氏管激素受体2(AMHR2)一种新的转录本,确定其在大鼠组织中的表达情况.采用TRIzol法提取组织总RNA;运用RT-PCR和克隆测序技术分析AMHR2基因的可变剪接体及其在大鼠各组织器官中的表达差异,同时利用NCBI ORF Finder识别剪接体序列阅读框,运用ExPASy-ProtParam和Conserved domains软件分别预测剪接体氨基酸构成及其性质和剪接体保守序列.AMHR2-SV1是AMHR2的一种新型转录本,命名为AMHR2-splice variant(AMHR2-SV1),与AMHR2参考序列比较,缺失第10外显子137 bp.利用NCBI ORF Finder和ExPASy-ProtParam,预测AMHR2-SV1编码429个氨基酸残基,其编码的蛋白质分子量为45 990.7.Conserved domains在线软件分析表明:AMHR2-SV1蛋白序列比完整AMHR2蛋白序列缺少128个氨基酸,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域不完整.检测结果表明,大鼠组织中均存在AMHR2和AMHR2-SV1两个转录本.在肝、脾、肺、肾、肾上腺和子宫组织中AMHR2表达量均高于AMHR2-SV1,差异达到显著水平;两种转录本在不同组织中表达趋势相同,卵巢中表达量最高,心脏中次之,其他组织表达量均显著低于卵巢和心脏.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐银学	南京农业大学动物科学技术学院	55	455	10.0	19.0
2	牛亚茹	南京农业大学动物科学技术学院	5	21	2.0	4.0
3	徐明龙	南京农业大学动物科学技术学院	3	7	2.0	2.0
4	郭保平	南京农业大学动物科学技术学院	3	7	2.0	2.0