儿童与成人慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒Core基因区准种特征及正选择压力差异分析

• 作者: 邓海君 黄勇 黄爱龙 龙泉鑫
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 乙型肝炎病毒 Core基因区 儿童病例 正选择压力
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 465-472
• 页数: 8页
• 字数: 5156字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.15-060

摘要

儿童与成人慢性乙型肝炎患者的临床特征差异明显.乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus, HBV)病毒准种特征与其致病特性紧密相连,HBV病毒Core 基因区富含免疫表位,该区域的准种特征直接反映病毒变异与病毒应对宿主免疫压力间的动态过程.文章通过扩增170名儿童慢性乙型肝炎患者及121名成人慢性乙型肝炎患者病毒Core基因区,按照病毒基因型以及病毒e抗原(Hepatitis B virus e antigen, HBeAg)状态进行分组,使用序列复杂度、多样性、非同义突变率(Non-synonymous substitution ratio,dN)、同义突变率(Synonymous substitution ratios ,dS)等指标衡量不同组别之间的病毒准种特征;使用不同模型计算不同组别中受到正选择压力的位点,进一步结合HBV Core基因区免疫表位信息,进行正选择位点的定位分析.结果发现,儿童乙型肝炎病毒患者体内病毒Core基因区序列复杂性和多样性低于成人患者,且前者Core基因区正选择位点个数显著低于后者,这说明儿童慢性乙型肝炎患者体内病毒受到的选择压力低于成人患者.在儿童及成人慢性感染病人组中, HBeAg 阳性病人体内病毒受到的选择压力低于 HBeAg 阴性病人.儿童及成人慢性感染患者体内病毒存在 13个正选择位点,大多数正选择位点位于已知的抗原表位上.本研究从分子进化角度揭示了儿童与成人慢性乙型肝炎病例体内病毒Core基因区序列准种差异,为两类病人显著不同的临床表征提供了群体遗传学的解释.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄勇	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	12	73	6.0	8.0
5	黄爱龙	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	236	1190	16.0	23.0
6	邓海君	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0
7	龙泉鑫	重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室	4	12	3.0	3.0