利用目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记分析梨遗传多样性

• 作者: 张金云 徐超 方志 杨君祎 杨芳梅 林毅 蔡永萍 闫冲冲
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 梨 目标起始密码子多态性(SCoT) 遗传多样性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 588-597
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.05.004

摘要

目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)是一种新型的遗传分子标记技术.本研究采用单因素水平设计方法,优化并建立梨的适宜SCoT分子标记体系,通过SCoT标记技术,分析了安徽省砀山县的43份梨(Pyrus spp.)的遗传多样性和亲缘关系.结果表明,优化后梨SCoT-PCR反应体系:10×Easy Taq Buffer(含2 mmol/L Mg2+)2.5 μL,模板DNA终浓度30 mg/L,上下游引物终浓度1.0 μmol/L,dNTPs终浓度0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U,总体积为25 μL.随机选取2个DNA模板进行引物筛选,最终从67条引物中筛选出16条扩增条带清晰且有差异性的引物,共扩增出145条带,其中多态性条带有126条,多态性比率为86.1％,每条引物平均扩增出9.1条带.SCoT标记的43个梨材料遗传相似性系数为0.517～0.931,平均值为0.685.聚类分析表明,在遗传相似系数为0.610的水平上,43份梨材料分为A和B两组;在遗传相似系数为0.746的水平上,A组又分为6个亚组(Ⅰ～Ⅵ).所研究的43份梨材料具有丰富的遗传多样性,且能够被SCoT分子标记有效地检验,为进一步研究利用安徽省砀山县梨种质资源提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永萍	安徽农业大学生命科学学院	167	2775	29.0	45.0
2	张金云	安徽省农业科学院园艺研究所	56	437	12.0	18.0
3	林毅	安徽农业大学生命科学学院	139	2078	27.0	38.0
4	方志	安徽农业大学生命科学学院	5	20	3.0	4.0
5	闫冲冲	安徽农业大学生命科学学院	4	53	3.0	4.0
6	杨君祎	安徽农业大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0
7	徐超	安徽农业大学生命科学学院	2	6	1.0	2.0
8	杨芳梅	安徽农业大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0