苹果部分种质资源分子身份证的构建

• 作者: 刘凤之 刘立军 王大江 王昆 高源 龚欣
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 苹果 种质资源 TP-M13-SSR 分子身份证
• 年，卷（期）: 2015,（19）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 3887-3898
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.19.011

摘要

【目的】以国家果树种质兴城梨、苹果圃保存的131份苹果地方品种、育成品种及其野生近缘种为试材，利用TP-M13-SSR标记构建苹果种质分子身份证。【方法】基于TP-M13-SSR指纹图谱，筛选可以将苹果种质区分的引物组合，并对其等位基因进行编码建立种质分子身份证。【结果】（1）从131份材料中随机选取两份材料，对第一次PCR条件进行优化和引物筛选，从32对合成引物中筛选出16对稳定性高和重复性好的TP-M13-SSR引物用于131份苹果属植物指纹图谱构建。（2）16对SSR引物在供试种质间共检测出等位基因326个，每对引物平均检测到等位基因数为20.3个。CH05d04对种质扩增的等位基因数最多为49个，位点期望杂合度最高为0.878；其次是CH01f07a为48个。利用PopGen32软件计算引物的多态性信息含量，16对引物的平均多态性信息含量为0.7558。16对SSR引物可区分供试苹果种质资源数量从11份到71份不等，平均每对SSR引物可区分49份苹果种质，区分率为8.09%—52.21%。其中对苹果种质区分率最高的是 CH01f07a，最低的为 BGT23b。（3）根据引物扩增的多态性信息含量和对苹果种质的区分率，将两者均较高的引物CH05d04、CH01f07a、CH03d07、CH04e03、CH04h02和CH04g07两两组合，CH04h02和CH01f07a引物组合分辨率最高，可以区分120份苹果种质。继续增加组合中引物数量，在增加到3对引物时，即可将全部苹果种质区分开来。（4）把可以将全部供试苹果种质资源材料全部区分的3对核心引物CH04h02、CH05d04和CH01f07a获得等位基因按照从大到小的顺序排列，并用阿拉伯数字从01开始赋值；将每份材料在3个位点获得的等位基因按照赋值数字编码获得每份供试材料独有的字符串，利用条码技术将每对引物的分子身份证转化成可被机器快速扫描的条码分子身份证。【结论】依据引物扩增的多态性信息含量和对苹果种质的区分率，筛选核心引物组合，区分全部供试苹果地方品种、育成品种及其野生近缘种质资源，并基于指纹图谱构建其可被机器快速识别的分子身份证，使每份种质具有可辨的分子身份证，达到利用最少、最特异引物区分最多苹果种质的目的。