胚胎附植期梅山猪EphrinA1全编码区克隆及生物信息学分析

• 作者: 付言峰 任守文 刘红林 周艳红 赵为民
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 关键词: 梅山猪 胚胎附植 EphrinA1 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 350-356
• 页数: 7页
• 字数: 4823字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.02.020

摘要

为了研究促红细胞生成素产生肝细胞配体A1(EphrinA1)对梅山猪胚胎附植期胚胎在子宫内膜间迁移和对子宫内膜黏附活动的影响,利用克隆测序、生物信息学和qRT-PCR方法,克隆了EphrinA1基因的全长编码序列,对其表达的蛋白结构和功能进行了预测,并检测了其mRNA表达变化.梅山猪EphrinA1基因编码区有5个cSNPs变异,其中2个导致氨基酸突变,分别为Glu29Asn和Trp33Arg,位于EphnA1外显子1和外显子2上.EphrinA1编码序列中含5个外显子,编码205个氨基酸.EphrinA1为不稳定的亲水性蛋白,有1个信号肽和一个保守区域,无跨膜区.另外,EphrinA1在梅山猪胚胎附植期有较强的mRNA表达.表明EphnnA1基因可能参与梅山猪的胚胎附植调控,其cSNPs有望成为影响猪产仔数基因的潜在分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘红林	南京农业大学动物科技学院	116	1257	21.0	30.0
2	任守文	南京农业大学动物科技学院	58	191	7.0	10.0