[目的]为了揭示山东省韭菜迟眼蕈蚊Bradysia odoriphaga Yang et Zhang种群共生菌Wolbachia的感染率及其分类地位,探讨该共生菌对韭菜迟眼蕈蚊的潜在影响.[方法]利用线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(mtCOⅠ)基因引物(LCO1490/HCO2198),通过扩增测序和序列比对对采自山东省12个地区的根蛆种群进行了分类鉴定.在上述基础上,利用Wolbachia的16S rDNA和wsp基因特异引物(分别为16S-F/16S-R和81F/691R)对鉴别出的11个韭菜迟眼蕈蚊种群体内Wolbachia感染情况进行了PCR检测;对感染个体体内Wolbachia依据16S rDNA基因片段序列进行分类鉴定.[结果]山东省12个根蛆种群中,11个种群为韭菜迟眼蕈蚊种群.基于Wolbachia的16S rDNA基因特异引物检测结果发现,这些韭菜迟眼蕈蚊种群广泛感染Wolbachia(感染率为6.67%~93.33%),而利用wsp基因特异引物检测的感染率(0.00%~40.00%)相对较低些.基于Wolbachia的16S rDNA基因构建系统发育树表明,这些韭菜迟眼蕈蚊种群感染的Wolbachia全部属于A组.[结论]确定了Wolbachia在山东省韭菜迟眼蕈蚊体内的感染率及其分类地位,为研究Wolbachia对韭菜迟眼蕈蚊生物学及生态学的影响奠定了基础.