中国红豆杉TcAPLs基因的克隆及表达分析

• 作者: 刘洪伟 李艳艳 杨艳芳 王帅 邱德有
• 来源期刊: 中草药
• 关键词: 中国红豆杉 APL基因 基因克隆 生物信息学分析 表达
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1512-1519
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.10.020

摘要

目的 克隆中国红豆杉altered phloem development (APL)基因,研究APL在中国红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况,以揭示其可能的调控作用机制.方法 利用反转录PCR (RT-PCR)方法克隆得到3个中国红豆杉APL (TcAPLs)基因的cDNA全长序列,分别命名为TcAPL1、TcAPL2和TcAPL3,进一步利用生物信息学工具对其进行分析,最后利用半定量RT-PCR对中国红豆杉不同组织和qRT-PCR技术对其剥皮再生不同时期的TeAPLs进行表达分析.结果 系统进化树结果显示,TcAPL1与TcAPL2编码的蛋白与川桑的APL蛋白亲缘关系最近,聚为一类;TcAPL3处在APL另一个大的独立分支上.组织表达谱分析表明TcAPL1和TcAPL2 2个基因主要在根、茎、叶片和韧皮部(含形成层)中均高表达;TcAPL3在叶片中表达量较高,而在根和木质部(含形成层)表达较低.在中国红豆杉剥皮再生过程中,TcAPL1和TcAPL2 2个基因的表达水平随着时间的延长表现为先上升后下降的趋势,均在36d下降最明显;TcAPL3的表达则在整个组织再生过程中被抑制.结论 克隆了3个TcAPLs基因,3个基因在中国红豆杉剥皮再生过程中均有响应,推测它们在中国红豆杉植物剥皮后组织再生中起一定的调控作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邱德有	中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室	33	592	13.0	24.0
2	刘洪伟	中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室	5	36	3.0	5.0
3	杨艳芳	中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室	8	48	4.0	6.0
4	王帅	中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室	4	11	2.0	3.0
5	李艳艳	中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室	2	6	2.0	2.0