缢蛏IGFBP基因结构及生长性状相关SNP筛选

• 作者: 李家乐 牛东红 王泽 王飞 谢淑媚 阮海灯 陈世娥
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 缢蛏 类胰岛素生长因子结合蛋白(IGFBP) 基因表达 单核苷酸多态性(SNP) 关联分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 页码范围: 799-809
• 分类号: Q785|S966.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20141209622

摘要

类胰岛素生长因子结合蛋白(IGFBP)是IGF系统的一部分,主要参与IGF的运输、定位和生物活性调节.本研究采用RACE技术和长PCR技术,克隆了缢蛏IGFBP基因的cDNA和DNA全长序列,应用荧光定量PCR技术分析了缢蛏不同发育时期和不同组织中IGFBPmRNA的表达特征,并进一步筛选了IGFBP基因与生长性状相关的SNP位点.序列分析表明,缢蛏IGFBP cDNA序列全长631 bp,包括5'端非编码区60 bp,3'端非编码区136 bp和开放阅读框435 bp,编码144个氨基酸.该基因含有保守的IGFBP-N端,包含12个半胱氨酸残基,其中1 ～18个氨基酸为信号肽,属于分泌型蛋白.IGFBP DNA全长3 122 bp,其中包含1个内含子(2 687 bp)和2个外显子(200和235 bp).荧光定量PCR结果显示,IGFBP mRNA在消化腺组织中表达量最高;在缢蛏的稚贝期,IGFBP mRNA呈现高表达,而在其他发育时期表达量低.在IGFBP基因中筛选到4个SNP位点,其中1个SNP位点与缢蛏的壳长和体质量呈显著相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李家乐	上海海洋大学农业部	91	1011	19.0	27.0
2	牛东红	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	27	216	10.0	14.0
3	王飞	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	4	26	2.0	4.0
4	谢淑媚	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	3	22	2.0	3.0
5	阮海灯	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	19	1.0	1.0
6	王泽	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	19	1.0	1.0
7	陈世娥	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	19	1.0	1.0