DNA条形码在鲱形目鱼类物种鉴定和系统进化分析中的应用

• 作者: 庄志猛 李献儒 李达 杜腾飞 柳淑芳
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲱形目 CO Ⅰ基因 DNA条形码 遗传距离 系统进化
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1133-1141
• 页数: 9页
• 分类号: Q959
• 字数: 6162字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2015.15090

摘要

采用PCR特异性扩增获得中国近海鲱形目(Clupeiformes)2科6属7种的48条线粒体CO Ⅰ基因序列,结合从GenBank筛选出的4科40属83种的CO Ⅰ基因序列225条,对鲱形目鱼类的CO Ⅰ条形码基因特征、种内与种间遗传距离及其分子系统进化关系进行了分析,探索了DNA条形码技术在辅助鱼类物种鉴定和分类中的适应性.结果表明,4科41属90种273条CO Ⅰ基因序列的平均碱基组成为T:28.3％、C:28.3％、A:24.2％、G:19.2％,碱基组成表现出明显偏倚性.鲱形目鱼类种间的平均遗传距离为0.131,种内平均遗传距离为0.003,种间距离为种内距离的41倍;系统学分析结果显示,97.8％的鱼类在系统进化树上均为单系.可见,鲱形目鱼类DNA条形码符合物种鉴定的要求,且基于CO Ⅰ基因所建的NJ树对物种分类具有较为准确的辨识力.系统进化分析结果表明,COⅠ基因不仅能够解决低阶分类单元的系统进化关系,对于高阶分类单元的系统分析研究结果也有一定参考价值.