利用16Sr-DNA高通量测序技术对发酵床垫料微生物区系的分析

• 作者: 吴志勇 娄佑武 杨艳 涂凌云 王荣民 管业坤
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 16Sr-DNA高通量测序 发酵床 微生物区系 菌种 垫料
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 生态养殖
• 页码范围: 72-79
• 页数: 8页
• 分类号: S811.5
• 字数: 5786字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在了解发酵床养猪垫料微生物菌群区系结构,探索菌种及垫料对发酵床垫料微生物区系的影响.将商业菌、土著菌分别接种于含稻壳与锯末成分比为1∶1和2∶1垫料中,制作成四个处理组的发酵床,经154 d猪饲养试验后,收集发酵床垫料,采用16 Sr-DNA高通量测序技术对发酵床中微生物区系进行测定分析.结果表明:(1)丰富度方面,土著菌(Chao指数:10175～10754)丰富度高于商业菌(Chao指数:6720～7554);(2)相似性方面,商业菌种处理的菌群结构受垫料因素的影响较小,土著菌处理的菌群结构受垫料因素的影响较大;(3)多样性方面,垫料对菌群多样性的影响较菌种对其的影响大,且稻壳与锯末比值为2∶1的垫料微生物多样性(shannon指数:6.64～6.91)高于稻壳与锯末比值1∶1的垫料微生物多样性(shannon指数:5.90～5.94);(4)菌群组成方面,发酵床垫料菌群主要由4个门组成:拟杆菌门(27.66％～60.93％)、厚壁菌门(13.41％～34.21％)、变形菌门(10.28％～14.71％)和放线菌门(4.63％～26.24％),并从属水平上确定了Galbi-bacter为发酵床垫料微生物的优势菌属.试验发现菌种和垫料对发酵床垫料微生物区系的丰富度、相似性、多样性均有不同程度的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王荣民		53	68	4.0	5.0
2	吴志勇		50	104	5.0	7.0
3	管业坤		30	22	3.0	4.0
4	娄佑武		31	41	3.0	4.0
5	杨艳		26	29	3.0	4.0
6	涂凌云		8	18	3.0	3.0