我国部分冬小麦品种(系)遗传多样性、群体结构和连锁不平衡分析

• 作者: 吴丹 石引刚 董剑 要燕杰 赵万春 陈良国 高翔
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 小麦 简单序列重复(SSR)标记 遗传多样性 群体结构 连锁不平衡
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 863-875
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.07.003

摘要

为了筛选与产量性状或品质性状显著关联的分子标记,本研究利用分布于不同染色体上的88对简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)标记对91份我国冬小麦(Triticum aestivum L.)品种(系)进行了位点多态性分析、基于非加权平均法的聚类分析、基于数学模型的群体结构和连锁不平衡分析.结果表明,全部标记共检测到883个等位变异,平均等位变异是10.03;遗传多样性变化范围为0.160～0.932,平均值是0.703;多态性信息含量变化范围为0.148～0.929,平均值是0.667.这些结果显示目前我国冬小麦遗传多样性水平相对较低.其中B基因组的遗传多样性最高,D基因组最低.在多样性指数上,B基因组和D基因组差异显著(P＜0.05).聚类分析将材料分成3大类,群体结构分析将材料分成4个亚群,类群划分结果与地理来源无明显关系,与系谱来源部分相关.聚类分析和群体结构分析相互补充和印证,使类群划分更加可靠.AMOVA分析显示,材料94％的遗传变异是由群体内不同个体间的差异造成的,6％的遗传变异与群体间的遗传分化有关.基因流数据显示不同的群体或亚群间存在着更频率的基因交流.基因组连锁不平衡衰减距离的“基准线”是r2=0.028 7,全基因组、A、B和D基因组连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)衰减距离分别是4.3、3.7、1.0和4.1 cM.B基因组LD衰减距离较短、衰减较快;A和D基因组LD衰减距离较长、衰减较慢.表明我国小麦LD衰减距离较高,采用全基因策略进行关联分析是可行的.评价我国小麦品种(系)的遗传多样性、群体结构和连锁不平衡,可为今后小麦杂交育种、分子标记辅助选择和关联分析提供参考和依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高翔	西北农林科技大学农学院	64	515	12.0	20.0
2	董剑	西北农林科技大学农学院	38	288	9.0	15.0
3	赵万春	西北农林科技大学农学院	30	294	9.0	16.0
4	吴丹	西北农林科技大学农学院	6	109	5.0	6.0
5	石引刚	西北农林科技大学农学院	6	34	3.0	5.0
6	陈良国	西北农林科技大学农学院	3	8	1.0	2.0
7	要燕杰	西北农林科技大学农学院	2	14	2.0	2.0