DNA甲基化分析中重亚硫酸盐处理DNA转化效率的评估方法

• 作者: 刘洋洋 崔恒宓
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: DNA甲基化 重亚硫酸盐 TaqMan qPCR 转化率
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 939-944
• 页数: 6页
• 字数: 3217字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.15-129

摘要

为建立一种评估重亚硫酸盐处理DNA样本后胞嘧啶转化效率的有效方法，以两组不同的TaqMan qPCR检测梯度稀释的重亚硫酸盐处理和未处理的DNA标准品，建立转化与未转化的DNA Ct值以及对应的DNA拷贝数的标准曲线。使用相同的探针定量检测重亚硫酸盐处理后的 DNA样本评估转化效率。结果显示该方法应用两组探针，根据相应的标准曲线，精确评估样本经重亚硫酸盐处理的转化效率。使用已知转化和未转化拷贝数的混合 DNA 作为模板，证实了该方法的可靠性。同时也对不同重亚硫酸盐试剂盒处理 DNA 的转化效率进行了评估，结果显示，该方法能够有效地评估 DNA 样品重亚硫酸盐的转化效率，为 DNA 甲基化准确分析提供了可靠快捷的方法。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘洋洋	南京大学医学院江苏分子医学重点实验室	9	9	2.0	2.0
2	崔恒宓	南京大学医学院江苏分子医学重点实验室	10	19	3.0	4.0