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5株北极微藻藻际环境的细菌多样性
5株北极微藻藻际环境的细菌多样性
作者:
李会荣
杜宗军
楼妍颖
罗玮
苗祯
原文服务方:
生态学报
北极微藻
藻际环境
关联菌群
16S rRNA
DGGE
摘要:
对5株北极微藻,如脆杆藻(Fragilariopsis sp.)、微单胞藻(Micromonas sp.)、四棘藻(Attheya septentrionalis)、海链藻(Thalassiosira sp.)和小球藻(Chlorella sp.)的不同生长时期的粘附细菌和游离细菌的16S rRNA基因进行PCR-DGGE分析,研究藻际环境的细菌多样性.结果表明,5株微藻具有不同的藻际微生物群落结构组成,其中微单胞藻、脆杆藻、四棘藻和海链藻的藻际细菌主要由Cyanobacteria(藻蓝细菌)、α-Proteobacteria(α-变形菌纲)和γ-Proteobacteria(γ-变形菌纲)组成,仅微单胞藻和脆杆藻检测出CFB(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides,噬纤维菌-屈挠杆菌-拟杆菌).小球藻由Cyanobacteria、CFB、α-Proteobacteria和β-Proteobacteria(β-变形菌纲)组成.微单胞藻的藻际菌群结构稳定,不同生长时期的游离细菌和粘附细菌组成差异不明显.3株硅藻-脆杆藻、四棘藻和海链藻的游离细菌主要由γ-Proteobacteria组成,小球藻的游离细菌主要为β-Proteobacteria,而5株微藻的粘附细菌主要由Cyanobacteria组成.从DGGE图谱来看,在脆杆藻生长的延滞期、指数期和稳定期,其藻际游离细菌和粘附细菌的16S rRNA基因扩增条带数量和位置均有明显差异,但优势扩增条带较稳定;其他4株藻粘附细菌和游离细菌的扩增条带比较稳定,说明藻际关联菌群结构较稳定.藻菌种间特异性关系为不同微藻藻株提供了重要的线索,同时也带来更多的隐藏在藻际环境中的信息.
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文献信息
篇名
5株北极微藻藻际环境的细菌多样性
来源期刊
生态学报
学科
关键词
北极微藻
藻际环境
关联菌群
16S rRNA
DGGE
年,卷(期)
2015,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1587-1600
页数
14页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.5846/stxb201305070961
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
李会荣
中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室
13
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9.0
13.0
2
罗玮
中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室
5
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3.0
5.0
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楼妍颖
中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室
1
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研究主题发展历程
节点文献
北极微藻
藻际环境
关联菌群
16S rRNA
DGGE
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生态学报
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-0933
CN:
11-2031/Q
开本:
16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1981-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
14991
总下载数(次)
0
总被引数(次)
516896
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