脊髓灰质炎病毒减毒活疫苗中Ⅲ2株全基因测序及序列分析

• 作者: 岳磊 李华 杨婷 杨蓉 罗芳宇 董莉娟 谢忠平 龙润乡
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 脊髓灰质炎减毒活疫苗 中Ⅲ2毒株 基因组序列
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 115-120,128
• 分类号: R373.2+2|Q78
• 语种: 中文

摘要

目的 对脊髓灰质炎病毒减毒活疫苗中Ⅲ2株全基因进行测序,并与P3/Leon/37株和SabinⅢ株的全基因序列进行同源性比较.方法 通过大片段克隆和小片段克隆两种方法,采用RT-PCR法扩增覆盖中Ⅲ2株基因组全长且互相重叠的4个大片段和8个小片段,基因组中间片段的PCR产物直接测序,基因组末端的片段先进行TA克隆再测序.分别将两种方法得到的cDNA片段进行拼接,并将所得全长cDNA序列与P3/Leon/37株和SabinⅢ株的全基因序列进行同源性比较.结果 两种方法均能得到长度为7 432 bp的中Ⅲ2株全长cDNA序列,且碱基序列完全一致;中Ⅲ2株全基因序列与P3/Leon/37株和SabinⅢ株全基因序列的同源性均为99％;中Ⅲ2株与P3/Leon/37株的碱基序列差异共有19处(非编码区3处和编码区16处),编码区有6个基因突变导致氨基酸序列的改变;中Ⅲ2株和SabinⅢ株的碱基序列差异共有28处(非编码区13处和编码区15处),编码区有3个基因突变导致氨基酸序列的改变.结论 中Ⅲ2减毒疫苗株全基因组cDNA序列为7 432 bp,与SabinⅢ株全基因序列的同源性为99％.