条斑紫菜SSU中内含子分析

• 作者: 徐佳杰 李星辰 林中姮 沈颂东
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 条斑紫菜(Porphyra yezoensis) rRNA基因 内含子 同质性 系统发育
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 12-18
• 页数: 7页
• 分类号: Q523+.8
• 字数: 3988字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20130930001

摘要

根据GenBank中已知的条斑紫菜(Porphyra yezoensis)SSU和LSU rRNA基因序列分别设计引物,分别以混合个体和单个个体的基因组DNA以及cDNA为模板进行扩增,测序分析后推测SSU rRNA基因中的内含子转录后加工可能仍被保留,而在 LSU rRNA 基因上游序列中没有发现内含子。长511bp的内含子位于 SSU rRNA 基因序列的上游,其插入位点为 TCTGGTG-CCAGCAGCC,内含子5′和3′端的核苷酸序列分别为AAC-和-ATGG。该内含子的剪接位点以及保守区P, Q, R, S与I型内含子是不同的。研究发现,在同种紫菜中,不同个体 SSU 基因中内含子的有无、分布及结构特征是不同的,说明内含子对于分类是不太适合的。但是内含子的长度以及核苷酸序列在种间又具有一定的特异性,可以为红藻种间以及种内亲缘关系较远的亚种和不同地理群的区分和鉴定提供参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈颂东	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院细胞生物学系	71	1412	21.0	36.0
2	徐佳杰	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院细胞生物学系	3	0	0.0	0.0
3	李星辰	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院细胞生物学系	1	0	0.0	0.0
4	林中姮	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院细胞生物学系	1	0	0.0	0.0