运用 SNP-CAPS 分子标记定位香菇重要功能基因的研究

• 作者: 谭琦 鲍大鹏 黄杰
• 来源期刊: 上海农业学报
• 关键词: 香菇 功能基因 非同义 SNP SNP-CAPS 标记
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 字数: 3625字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2015.02.03

摘要

根据香菇单核菌丝体135A 和135B 的全基因组测序，通过生物信息学方法分析筛选出香菇功能基因 CAP、GLA1、TLG1结构域中的非同义 SNP 位点，开发出3对 SNP-CAPS 分子标记。结果表明：这3对功能基因SNP-CAPS 分子标记可将23个香菇单核体供试菌株分成135A 型（分别为16株、20株、2株）和135B 型（分别为7株、3株、21株），这些标记表现出的多态性为进一步研究香菇菌株的来源和功能基因的定位提供参考价值；并建立起可以简单、快速、准确地调查重要功能基因的 SNP 位点变异情况的方法。