基于高密度遗传图谱的玉米籽粒性状QTL定位

• 作者: 吴迅 宋燕春 张登峰 李春辉 李永祥 王天宇 白娜 石云素 秦伟伟 陈林 黎裕
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 玉米(Zea mays L.) 籽粒性状 数量性状位点(QTL) 高密度遗传图谱
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 1510-1518
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.01510

摘要

籽粒大小及百粒重是决定玉米产量的重要因素。为解析籽粒性状遗传基础,本研究以玉米自交系黄早四(HZS)和Mo17为亲本,构建包含130个重组自交系(recombination inbred line, RIL)的RIL群体。基于GBS (genotyping- by-sequencing)技术获得的高密度多态性SNP (single nucleotide polymorphism)位点,构建了包含1262个Bin标记的高密度遗传图谱。采用完备区间作图法,对5个环境条件下的粒长、粒宽、百粒重、粒长/粒宽4个性状分别进行QTL (quantitative trait locus)定位,共检测到30个QTL。利用5个环境性状均值,共检测到11个QTL。其中粒长主效QTL qklen1、粒长/粒宽主效QTL qklw1在3个单环境条件下均被检测到,且定位在第1染色体相邻区域,物理位置分别为210~212 Mb、207~208 Mb,表型贡献率分别为22.60%和26.79%,被认为是控制玉米籽粒形状的主效位点。针对第1染色体207~212 Mb区间,采用成组法t检验,对黄早四(受体)和Mo17(供体)构建的BC3F1回交群体进行单标记分析。结果表明,在 BC3F1群体中 qklen1和 qklw1同样具有显著的遗传效应。本研究结果不仅为分子标记辅助选择籽粒性状提供了实用标记,而且为主效基因的进一步精细定位和候选基因挖掘奠定了基础。