辣椒全基因组WRKY转录因子的分析

• 作者: 刁卫平 刘金兵 戈伟 潘宝贵 王述彬 郭广君
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 WRKY 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 蔬菜
• 页码范围: 2183-2196
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0436

摘要

基于已公布的辣椒全基因组数据,利用生物信息学方法对辣椒WRKY转录因子家族进行全面鉴定和系统命名,并在此基础上对基因分类、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了研究.结果表明:辣椒CaWRKY家族包含71个基因,根据WRKY结构域的数量及锌指结构的特征可将其分为Group Ⅰ、GroupⅡ和GroupⅢ等3大类,Group Ⅱ又可分为Ⅱ (a)、Ⅱ (b)、Ⅱ (c)、Ⅱ (d)和Ⅱ (e)等5个亚类.辣椒12条染色体上均有WRKY转录因子分布,其中第1号染色体上分布最多,共有10个,第4号染色体上分布最少,仅有2个.辣椒每类/亚类WRKY几乎含有相同的保守基序.辣椒WRKY编码的蛋白在132 ～ 869个氨基酸范围内,平均氨基酸数量为373个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王述彬	江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	99	728	13.0	22.0
2	刁卫平	江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	35	144	7.0	10.0
3	刘金兵	江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	85	622	13.0	21.0
4	潘宝贵	江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	81	546	13.0	19.0
5	郭广君	江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	14	57	5.0	7.0